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河豚鱼16S rRNA基因部分DNA序列分析及应用

阅读:
2017-06-07 来源:食品科学网
责任编辑:食品科学
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  作者:陈文炳,翁国柱,陈融斌,缪婷玉,邵碧英,江树勋,彭 娟

  关键词:河豚鱼;聚合酶链式反应;16S rRNA基因;DNA测序;物种鉴定

  内容:应用16S rRNA基因聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增通用引物,对3 属13 种福建省搜集的河豚鱼样品与9 个未知物种的河豚鱼样品的16S rRNA基因序列中的部分片段进行PCR扩增与脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)碱基序列测定,各物种序列长度在611~614 bp之间。应用DNAMAN V6软件进行样品间DNA序列同源性比对分析,建立样品间系统关系同源树。供试13 个样品被划分为4 个类群组,群间的同源率为87%,群内同源率为94%~100%。根据序列同源性分析结果,9 个未知种名的样品被归类到3 个类群组中,推测9 个未知种名的样品为东方鲀属或腹刺鲀属。探讨了16S rRNA基因部分DNA序列测试及同源性分析技术在河豚鱼种属鉴别中应用的可能性。

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