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西南林业大学阚欢教授、刘云高级实验师等:基于斑马鱼模型及网络药理学研究云南金花茶多酚的抗炎作用
2023-08-29作者:来源:责任编辑:食品界 字体A+AA-
植物多酚是植物体内的次生代谢产物,主要存在于植物体的皮、根、叶、果中。植物多酚表现出多种生理功能。云南金花茶(Camellia fascicularis)是一种富含多酚的药食同源植物,素有“植物界大熊猫”“茶族皇后”之称。斑马鱼作为一种新型模式脊椎生物,与人类基因有着87%的高度同源性,具有体积小、胚胎发育速度快、胚体透明等优点。
西南林业大学高妙姿、阚欢*、刘云*等采用斑马鱼模型评价云南金花茶多酚(CFP)抗炎活性,借助超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UPLCQ-TOF-MS/MS)技术鉴定其酚类化合物组成,并基于网络药理学方法获得CFP和炎症的共同作用靶点,通过基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析其作用特点,最后借助分子对接技术对多酚类关键成分和核心蛋白分子进行结合位点模拟验证,以期为深入研究CFP预防或治疗炎症的物质基础及作用机制提供数据支持。
1、最大耐受浓度分析结果
2、细菌感染性炎症治疗功效评价
3、CFP中的酚类化合物鉴定结果
4、有效成分潜在靶点获取
5、炎症靶点获取
以“inflammation”为关键词,在DisGeNET和GeneCards数据库中检索炎症的作用靶点。将19 个有效成分作用靶点与在DisGeNET数据库检索到的577 个靶点和在GeneCards数据库检索到的10 950 个靶点构建Venn图(图3),得到32 个有效成分和炎症的交集靶点,交集靶点信息见表4。
6、PPI网络分析结果
7、GO功能富集分析
以“P<0.01”为评价标准,对32 个交集靶点进行GO功能富集分析。结果如图5所示,共得到18 个生物过程条目、4 个细胞组分条目和10 个分子功能条目。交集靶点主要涉及凋亡过程的负向调节(negative regulation of apoptotic process)、炎症反应(inflammatory response)、血小板激活(platelet activation)等生物过程;细胞质(cytoplasm)、质膜细胞质侧的外源性成分(extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane)、应力纤维(stress fiber)等细胞组分;蛋白激酶活性(protein kinase activity)、酶结合(enzyme binding)、三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)结合、受体结合(receptor binding)等分子功能。
8、KEGG通路富集分析
以“P<0.01”为标准,对32 个交集靶点进行KEGG通路富集分析。结果如图6所示,CFP预防或治疗炎症的作用靶点主要富集在花生四烯酸代谢(arachidonic acid metabolism)、低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路、血小板激活(platelet activation)、癌症相关通路(pathways in cancer)等14 条信号通路上,且花生四烯酸代谢通路、HIF-1信号通路、血小板激活通路与CFP抗炎作用关系最为密切。
9、分子对接结果
借助PyMOL软件将结合能靠前的对接结果进行可视化分析。结果如图8所示,云南金花茶中关键成分3,3’,4-三甲氧基鞣花酸通过与GAPDH的ALA-238、ASN-239、PRO-236、LEU-203残基形成8 条氢键,与MMP2的LEU-137、PRO-134、ILE-141残基形成4 条氢键,与PTGS2的TYR-130、GLY-135、GLN-42、CYS-41、CYS-46、HIS-39残基形成7 条氢键;飞燕草素通过与MMP2的ILE-141、ASN-147、LEU-137、GLY-135残基形成5 条氢键;鞣花酸通过与GAPDH的GLN-204、ALA-238、ASN-239、PRO-236、LEU-203残基形成8 条氢键,与EGFR的ASP-1014、ALA-1013、GLN-791、LYS-852、THR-790、ARG-776残基形成9 条氢键。以上小分子均能稳定地置于受体蛋白的活性对接口袋中发挥抗炎作用。
讨 论
结 论
本文《基于斑马鱼模型及网络药理学研究云南金花茶多酚的抗炎作用》来源于《食品科学》2023年44卷11期134-142页.作者:高妙姿,唐军荣,邓佳,向建英,阚欢,赵平,张颖君,张贵良,刘云. DOI:10.7506/spkx1002-6630-20220525-318.