领学术科研之先，创食品科技之新
—— 中国食品杂志社
为全面了解Paenarthrobacter ilicis CR5301的遗传背景，深入解析CR5301转化莱鲍迪甙C（rebaudioside C，RC）的关键酶，采用二代Illumina HiSeq和三代Nanopore相结合的测序方法，对CR5301进行全基因组测序和关键酶预测分析。结果显示，CR5301基因组为1 个闭合环状染色体DNA分子，不含质粒，基因组序列全长4 748 281 bp，GC含量62.92%，共编码4 458 个基因，同时含有4 个基因岛、1 个前噬菌体和14 个CRISPR-Cas编码序列。CR5301是P. ilicis物种第1个测定基因组完成图的菌株，也是Paenarthrobacter菌属已知基因组最大的菌株。基因组共线性分析和16S rRNA基因系统进化树分析结果一致表明，P. ilicis CR5301与P. aurescens具有更近的亲缘关系，而与P. ureafaciens的亲缘关系较远。7 个蛋白质数据库综合注释分析发现，P. ilicis CR5301基因组共含有523 个碳水化合物活性酶基因，其中18 个糖苷酶基因可能是CR5301转化RC的关键酶基因。最后，通过ProtParam、SOPMA生物信息学软件，预测了18 个糖苷酶的物化性质和二级结构。这些结果为CR5301的RC转化机制研究提供了清晰、完整的遗传信息，并且为P. ilicis物种广泛的生物学研究提供了完整、可靠的参考基因组序列，对今后P. ilicis物种生物学研究具有重要的参考价值和普遍的借鉴意义。
2023年第44卷 2022年第43卷 2021年第42卷 2020年第41卷 2019年第40卷 2018年第39卷 2017年第38卷 2016年第37卷 2015年第36卷 2014年第35卷 2013年第34卷 2012年第33卷 2011年第32卷 2010年第31卷 2009年第30卷 2008年第29卷 2007年第28卷 2006年第27卷 2005年第26卷 2004年第25卷 2003年第24卷 2002年第23卷 2001年第22卷 2000年第21卷 1999年第20卷 1998年第19卷 1997年第18卷 1996年第17卷 1995年第16卷 1994年第15卷 1993年第14卷 1992年第13卷 1991年第12卷 1990年第11卷 1989年第10卷 1988年第09卷 1987年第08卷 1986年第07卷 1985年第06卷 1984年第05卷 1983年第04卷 1982年第03卷 1981年第02卷 1980年第01卷
电话: 010-87293157
地址: 北京市丰台区洋桥70号
版权所有 @ 2023 中国食品杂志社 京公网安备11010602060050号 京ICP备14033398号-2
