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发光细菌PB-P3.9的鉴定与gyrB、luxA基因系统发育分析
来源:食品科学网 阅读量: 127 发表时间: 2017-06-07
作者: 周明霞,陈勇喆,王 辉,陈 智,邓 乐
关键词: 发光细菌|明亮发光杆菌|gyrB基因|luxA基因|系统发育分析
摘要:

平板划线分离法从猪肉上分离得到一株发光细菌PB-P3.9,依据细菌DNA促旋酶B亚基基因(gyrB)、荧光素酶A基因(luxA)序列比对及构建系统发育树鉴定其种属,并探讨其来源。扩增gyrB、luxA基因并测序,两个基因序列比对结果与发光杆菌属的明亮发光杆菌(Photobacterium phosphoreum)分别有99%、98%的序列相似性,结合其生物学特性,确定PB-P3.9为一株明亮发光杆菌。根据GenBank 数据库中明亮发光杆菌标准菌株gyrB、luxA基因序列,采用距离法构建系统发育树,表明PB-P3.9株与标准菌株NCIMB 1279有最近亲缘关系,结合其生长条件,拟确定此发光细菌PB-P3.9来源于海洋深海鱼或中层海水浮游生物。

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