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基于多位点序列分型对新疆人及动物食品源性粪肠球菌种群进化关系解析
来源:食品科学网 阅读量: 105 发表时间: 2023-01-03
作者: 张雪玲,袁丽霞,张慧敏,田丰伟,倪永清
关键词: 粪肠球菌;多位点序列分型;遗传多样性;克隆复合群;种群结构
摘要:

从母乳、奶酪、马奶、驼奶以及冷水鱼肠道中共分离得到59 株粪肠球菌。通过多位点序列分型技术分析不同来源分离株的种群结构和进化关系。结果表明,59 株分离株被划分为12 个序列型,3 个克隆复合体和3 个独特型,没有序列型被划分为高风险克隆复合体。持家基因分裂分解分析结果显示,基因重组在粪肠球菌进化过程中发挥了重要的作用。通过最小生成树分析发现,粪肠球菌遗传关系与分离地区的相关性较弱。尽管eBURST和系统发育分析表明母乳源和冷水鱼源的粪肠球菌具有一定的宿主特异性,但在奶酪、驼奶和马奶中仍然可以检测到与其密切相关的粪肠球菌克隆。结果表明,来自不同宿主的粪肠球菌将适应新的生态位,并通过生产实践和食物链传播。为减少人畜共患病的潜在风险,有必要进行持续监测。

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