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基于RBL-2H3模型分析过敏反应效应细胞激活的差异基因
来源:食品科学网 阅读量: 124 发表时间: 2023-01-03
作者: 刘艳,谷福蝶,陈慧莹,李焱,周钰,张军,刘红,曹敏杰,刘光明,刘庆梅
关键词: 过敏反应;大鼠嗜碱性粒细胞;转录组测序;差异表达基因;信号通路
摘要:

构建IgE介导的大鼠嗜碱性粒细胞(rat basophilic leukemia,RBL)-2H3作为过敏反应细胞模型,并利用转录组测序分析比较RBL-2H3细胞激活前后的转录组基因差异,富集相关信号通路。IgE介导的RBL-2H3细胞激活后,过敏介质和细胞因子分泌显著提高;转录组测序得到RBL-2H3细胞激活前后的232 个差异表达基因,其中有127 个(54.74%)可进行基因功能注释;RBL-2H3细胞激活主要影响肿瘤坏死因子、丝裂原活化蛋白激酶、Janus激酶-信号转导与转录激活子、Toll样受体等信号通路,涉及的转录因子有MAP3K8、Nfkbia、Junb、Jun、Fos等。本研究建立了IgE介导的过敏反应体外细胞模型,并且通过对效应细胞转录组信息的全面分析和潜在靶点及信号通路的富集为过敏性疾病的防控治疗提供参考。

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