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—— 中国食品杂志社
通过PacBio RS II测序平台，对在腐败冷鲜鸡肉中分离到的1 株莓实假单胞菌（Pseudomonas fragi NMC25）进行基因组完成图测序，并对测序数据进行组装、基因预测和功能注释。同时与已公布全基因组序列的铜绿假单胞菌PAO1（P. aeruginosa PAO1）、恶臭假单胞菌KT2440（P. putida KT2440）和荧光假单胞菌F113（P. fluorescens F113）及另外2 株莓实假单胞菌分离株（P121和NRRLB-727）进行初步比较基因组分析。结果显示NMC25菌株基因组大小为5.152 13 Mb，GC含量为59.21%，包含1 个染色体和3 个质粒。通过对COG、GO、KEGG和CAZy数据库的比对分析发现基因组中包含大量致腐相关基因。比较基因组结果表明莓实假单胞菌NMC25与其他3 种假单胞菌的共线性序列比例较小，而同种之间与P. fragi P121的共线性比例也不足70%，说明不同环境来源的莓实假单胞菌分离株基因组存在较大差异。本研究结果从基因水平上证明了莓实假单胞菌NMC25确实有较强的致腐潜力，有助于深入了解莓实假单胞菌的代谢特征，为今后阐明其对冷鲜鸡肉的致腐机制提供理论支撑。
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