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应用高通量测序分析常温贮藏吴山贡鹅的细菌多样性
来源:食品科学网 阅读量: 123 发表时间: 2021-07-13
作者: 朱东喜,邓洁莹,王志琦,汪 洋,李沛军,徐宝才
关键词: 吴山贡鹅;传统培养;高通量测序;微生物分布;优势腐败微生物
摘要:

运用传统培养技术结合高通量测序技术对常温贮藏吴山贡鹅的菌群结构进行分析,研究吴山贡鹅微生物群落的变化以及导致吴山贡鹅腐败的微生物分布。结果表明:吴山贡鹅贮藏期间pH值呈现先上升后下降的趋势,菌落总数则呈现上升的趋势,贮藏末期吴山贡鹅中菌落总数、乳酸菌、大肠杆菌和假单胞菌的数量分别达到5.76、5.21、2.13、2.96 (lg(CFU/g));高通量测序分析表明,在门水平上,贮藏初期和中期,吴山贡鹅中的优势菌门均为变形菌门,其相对丰度分别达到88%(初期)和87%(中期),贮藏末期的优势菌门为厚壁菌门,相对丰度84%,在属水平上,吴山贡鹅贮藏初期和中期相对丰度最高的均为假单胞菌属和根瘤菌属,假单胞菌属相对丰度分别达到25%(初期)和34%(中期),根瘤菌属相对丰度分别达到25%(初期)和20%(中期),贮藏末期的优势菌属为副梭菌属(50%)和魏斯氏菌属(31%);同时,吴山贡鹅贮藏期间微生物的多样性分析结果表明,贮藏末期微生物的多样性与前期、中期有显著性差异;对微生物基因功能进行预测,得到吴山贡鹅贮藏初期、中期和末期的菌群功能基因相似,主要涉及包括氨基酸代谢和碳水化合物代谢在内的代谢途径等。

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