利用二代NovaSeq X Plus和三代PacBio Revio测序平台对分离自中国传统发酵蔬菜的短促生乳杆菌(Levilactobacillus brevis)PL6-1进行全基因组测序,并依托京都基因与基因组百科全书数据库,重建L. brevis PL6-1的碳水化合物代谢途径,同时分析该菌种的安全性及不同碳源对其抗氧化活性的影响。结果表明,L. brevis PL6-1基因组大小为2 632 919 bp,有2 618 个编码基因在非冗余蛋白质数据库被注释。基因组中富含糖基水解酶家族酶基因,但未发现耐药基因和毒力基因。表型实验结果表明,L. brevis PL6-1无溶血现象,对卡那霉素、庆大霉素和万古霉素耐药。在碳源利用方面,L. brevis PL6-1能够利用L-阿拉伯糖、核糖、D-木糖、半乳糖、葡萄糖、果糖、水杨苷、麦芽糖和海藻糖。其中,麦芽糖可快速启动L. brevis PL6-1的增殖;而以海藻糖和葡萄糖为主要碳源培养时,L. brevis PL6-1表现出更高的1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基清除率;以核糖为主要碳源培养时2,2′-联氮-双(3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)阳离子自由基清除能力最高。本研究通过全基因组分析和代谢途径重建,深入解析了L. brevis PL6-1的遗传信息特征和代谢特性,为其在食品工业中的安全应用提供了重要的理论依据,同时为该菌株的益生功能开发与利用奠定了科学基础。
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