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利用Illumina MiSeq高通量测序技术分析原料乳的菌群分布
来源:食品科学网 阅读量: 115 发表时间: 2019-09-26
作者: 于国萍,陈媛,姚宇秀,范美婧,刘鹏,董良伟
关键词: Illumina MiSeq高通量测序|原料乳|菌群分布情况
摘要:

为测定原料乳中的菌群分布情况,应用Illumina MiSeq高通量测序方法,主要对14?个奶牛场的原料乳进行采集,通过DNA测序确定菌群的多样性及致病菌的分布情况,进行操作分类单元聚类分析、Alpha多样性分析、物种分类分析3?方面的测定。结果表明不同牧场的菌群存在多样性,位于前列的分别是肠球菌属(Enterococcus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、不动杆菌属(Acinetobacter)、乳球菌属(Lactococcus),同时表明,个别牛场原料乳中有金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和志贺菌(Shigella)的存在。

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