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多基因DNA条形码鉴定6 个鳗鱼物种
来源:食品科学网 阅读量: 89 发表时间: 2018-01-08
作者: 陈文炳,邵碧英,缪婷玉,彭娟,陈彬,张志灯,江树勋
关键词: 16S rRNA基因;Cyt b基因;COⅠ基因;多基因DNA条形码;鳗鱼物种鉴定
摘要:

建立6 种鳗鱼的物种多基因DNA条形码精准鉴定方法。以鳗鱼DNA为模板,采用3 对通用引物对6 种鳗鱼的3 个基因(16S rRNA、Cyt b、COⅠ)部分DNA片段进行聚合酶链式反应扩增、测序,结果6 种鳗鱼各获得3 条16S rDNA(638~643 bp)、Cyt b(464~466 bp)、COⅠ(705~707 bp)基因部分DNA序列,从中选取各物种序列同源的片段设计3 对新引物对6 种鳗鱼的16S rRNA、Cyt b、COⅠ基因部分DNA片段进行PCR扩增,其产物大小分别为504~507、400、609 bp,再从各片段中筛选出具有6 种鳗鱼物种特异性强的、碱基数分别为262、280、300 bp的3 条DNA片段序列,作为6 种鳗鱼物种的3 个基因的标准DNA条形码,应用DNAMAN V6软件进行同源性分析,并通过GenBank数据库的比对验证,制定了供检测实践用的同源率判别指标,建立鳗鱼物种的多基因条形码检测方法。应用该方法对30 个待检鳗鱼样品进行检测,结果表明,各样品基于3 个基因DNA条形码的比对,符合同源率指标,物种判别结果互相吻合,从而精准判别样品的所属物种。该方法稳定、精准、易于操作,可应用于6 种鳗鱼的物种鉴定,值得推广。

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