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基于基因组的清酒广布乳杆菌遗传多样性研究
来源:导入 阅读量: 2 发表时间: 2026-09-05
作者: 冉小旭, 徐婷婷, 包凯迪, 陈仙兰, 王婵, 李永波, 张振东
关键词: 基因组特征|清酒广布乳杆菌|群体结构|基因组功能
摘要:

为分析清酒广布乳杆菌(Latilactobacillus sakei)的遗传多样性,深入理解其分子进化和生态适应机制,对已公开基因组序列的74株清酒广布乳杆菌开展了基因组比较分析、群体结构分析、正选择分析,并与已有的多位点分型方法进行比较。结果表明,清酒广布乳杆菌基因组大小为1.9~2.1 Mbp,GC含量为40.8%~41.2%,编码基因数量为1 776~2 134个。其基因组中含有与淀粉、纤维素、几丁质降解及葡聚糖、果糖、乳糖和半乳糖代谢相关的酶类基因,表明清酒广布乳杆菌能够适应多种环境。基于已公布的基因组数据,群体结构分析、系统发育分析和主成分分析表明,清酒广布乳杆菌可分为3个类群。正选择分析和基因组单核苷酸多态性(SNP)分布分析显示,基因rplR受到正选择作用,基因agrA的SNP位点数量最多。基于8个持家基因的多位点分型分析将74株菌划分为46个ST型,ST7为主要型别,且基因hemN显著重组。研究结果为深入解析清酒广布乳杆菌的功能差异和遗传进化提供了理论依据。

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